עבודת הסרת הלחות בחממה רב-שכבת חשובה מאוד. זוהי מעין חממה המורכבת ממספר חממות בודדות שחוברו יחד, ולכן יש צורך בעבודת הסרת הלחות שלה.
מכסים עם מאלץ'. השימוש בסרט חיפוי יכול להפחית את אידוי לחות הקרקע ומהווה אמצעי חשוב להפחתת לחות האוויר בתוך הבית. בנוסף, נעשה שימוש בחומר וילון הבידוד בעל ספיגת לחות טובה. חדירות הלחות הטובה וספיגת הלחות של חומר המסך התרמי יכולים למנוע נפילת טל על הצמחים, ובכך להפחית את לחות האוויר של החממה הרב-שכבתית.
להעלות את הטמפרטורה ולהפחית את הלחות. שימוש בשיטה זו יכול לא רק לענות על הצרכים של ירקות לטמפרטורה, אלא גם להפחית את הלחות היחסית של האוויר. כאשר הצמח גדל להתנגדות, השקה וסגור את הסככה להתחממות לכ-30 ℃ למשך שעה, ולאחר מכן אוורר את הלחות. ניתן לחזור על זה פעם אחת כאשר טמפרטורת הסככה נמוכה מ-25 מעלות לאחר 3-4 שעות. כמו כן, ניתן להשתמש בקש אורז, קש חיטה, סיד חצוי ועוד ספיגת לחות טבעית לפיזור החומר בין שורות לספיגת אדי מים או ערפל להשגת מטרת הסרת הלחות.